中文Nova različica koronavirusa, sev 501Y-V2 iz Južne Afrike
18. decembra 2020 je Južna Afrika odkrila mutant 501Y-V2 novega koronavirusa.Zdaj se je južnoafriški mutant razširil v več kot 20 držav.Poskusi so pokazali, da zgoraj navedeni novi mutanti virusa Corona lahko nosijo druge različice novega koronavirusa mutacij K417N/T, E484K in N501Y, ki lahko zmanjšajo nevtralizacijsko sposobnost s cepivom induciranih plazemskih nevtralizirajočih protiteles.Vendar ima v primerjavi z referenčnim genomom Wuh01 (zaporedna številka MN908947) 501Y.V2 zaporedja južnoafriškega mutantnega genoma 23 nukleotidnih različic.Ima enako mutacijo N501Y kot podtip britanskega mutanta B.1.1.7, vendar še vedno vsebuje mutacije na dveh ključnih mestih E484K in K417N proteina S, ki imata potencialno pomembne učinke na sposobnost virusa za okužbo.
Novi koronavirus je enoverižni RNA virus, pri katerem so mutacije genoma pogostejše.Enotarčno odkrivanje lahko zlahka povzroči zgrešeno odkrivanje vzorcev z nizko virusno obremenitvijo in mutiranimi virusnimi sevi.Stopnja ponovnega pregleda pri posameznem pozitivnem odkrivanju tarče lahko doseže več kot 10 %, kar lahko poveča delovno obremenitev in podaljša čas diagnoze.Odkrivanje več tarč in medsebojno preverjanje rezultatov vsake tarče lahko poveča stopnjo odkrivanja in olajša zgodnjo diagnozo.
Slika 1. Shematski diagram mehanizma okužbe z novim koronavirusom
Novi mutant koronavirusa B.1.1.7 iz Britanije
26. decembra 2020 je bil na spletu objavljen prvi znanstveni članek o sevu B.1.1.7.Inštitut za higieno Univerze v Londonu za Združeno kraljestvo in tropske bolezni je potrdil, da je sev B.1.1.7 bolj sposoben širjenja kot drugi sevi, kar je bilo več kot 56 % (95 % IZ 50–74 %).Ker ima ta novi mutirani sev večjo prenosno moč, je postalo težje nadzorovati COVID-19.Naslednji dan je Univerza v Birminghamu v Združenem kraljestvu naložila članek na MedRxiv.Študija je pokazala, da se je število genskih kopij virusa ORF1ab in N pri bolnikih, okuženih z mutantnim sevom B.1.1.7 (S-gene dropout), znatno povečalo;ta pojav so spremljali v populaciji.Ta članek poudarja, da imajo bolniki, okuženi z mutantom B.1.1.7 iz Velike Britanije, bistveno večjo virusno obremenitev, zato je ta mutant lahko tudi bolj patogen.
Slika 2. Zaporedje mutacij genoma, ki ga vsebuje mutantni sev B.1.1.7 koronavirusa iz Velike Britanije
Slika 3. Mutacija N501Y se je pojavila tako v Veliki Britaniji kot v Južni AfrikiRazličice
Komplet za odkrivanje novih različic koronavirusa
Podjetje Chuangkun Biotech Inc. je uspešno razvilo komplet za odkrivanje novih različic koronavirusa B.1.1.7 in 501Y-V2.
Prednosti tega izdelka: visoka občutljivost, hkratno zaznavanje 4 tarč, ki pokrivajo glavna mesta mutacije B.1.1.7 mutantnega seva in 501Y.V2 južnoafriškega mutantnega seva.Ta komplet lahko hkrati zazna mesta mutacije N501Y, HV69-70del, E484K in novi gen koronavirusa S;Hiter test: od odvzema vzorca do rezultata traja le 1 ura in 30 minut.
Slika 4. Krivulja pomnoževanja različice COVID-19 za Britanijo
Slika 5. Odkrivanje južnoafriške variante amplifikacije krivulje COVID-19
Slika 6. Krivulja pomnoževanja divjega tipa novega koronavirusa
Ni jasno, kako te mutacije kopičijo nove dolgoročne posledice pandemije COVID-19.Vendar nas to spomni, da lahko te mutacije vplivajo na učinkovitost naravne imunosti in imunosti, ki jo povzroči cepljenje.Opominja nas tudi, da moramo dolgo časa nenehno spremljati novi koronavirus in posodabljati cepivo proti COVID-19, da se spopademo z razvojem novega koronavirusa.
Čas objave: 12. marec 2021